Protein–RNA interactions for Protein: Q86UR5

RIMS1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS1Q86UR5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMS1Q86UR5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms