Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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