Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTOP1Q7RTM1 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTOP1Q7RTM1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms