Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF8

HSP90AB2P, Putative heat shock protein HSP 90-beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB2PQ58FF8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSP90AB2PQ58FF8 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSP90AB2PQ58FF8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB2PQ58FF8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms