Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
UPP1Q16831 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms