Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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NDUFA9Q16795 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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NDUFA9Q16795 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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NDUFA9Q16795 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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NDUFA9Q16795 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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NDUFA9Q16795 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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NDUFA9Q16795 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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NDUFA9Q16795 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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NDUFA9Q16795 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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