Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms