Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHPRHQ149N8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
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