Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms