Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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