Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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