Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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