Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1SQ13698 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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