Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTCH1Q13635 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
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