Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE3BQ13370 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
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