Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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FOXD4Q12950 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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FOXD4Q12950 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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