Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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RASGEF1BQ0VAM2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RASGEF1BQ0VAM2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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