Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms