Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms