Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms