Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms