Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms