Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms