Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD53P19397 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD53P19397 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD53P19397 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD53P19397 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD53P19397 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD53P19397 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD53P19397 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD53P19397 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD53P19397 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD53P19397 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD53P19397 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD53P19397 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD53P19397 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD53P19397 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD53P19397 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD53P19397 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD53P19397 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD53P19397 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD53P19397 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD53P19397 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD53P19397 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD53P19397 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD53P19397 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD53P19397 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD53P19397 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD53P19397 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD53P19397 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD53P19397 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD53P19397 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CD53P19397 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms