Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms