Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNPO3Q9Y5L0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNPO3Q9Y5L0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms