Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP18Q9UMW8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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