Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms