Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGXB4Q9UGU5 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms