Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RSG1Q9BU20 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms