Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LPIN3Q9BQK8 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms