Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms