Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms