Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms