Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC4Q8WW27 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms