Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCOLN3Q8TDD5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCOLN3Q8TDD5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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