Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 POLR3E-219ENST00000615879 3655 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 LRRCC1-201ENST00000360375 3813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 CDC25B-201ENST00000245960 3597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 SCN3B-206ENST00000530277 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 PAM-204ENST00000348126 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
OBSCNQ5VST9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms