Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTLL9Q3SXZ7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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