Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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