Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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