Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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SKP2Q13309 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SKP2Q13309 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SKP2Q13309 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SKP2Q13309 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SKP2Q13309 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SKP2Q13309 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKP2Q13309 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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