Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms