Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms