Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms