Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS4XP62701 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms