Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms