Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA6P31267 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA6P31267 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA6P31267 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA6P31267 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA6P31267 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA6P31267 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA6P31267 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA6P31267 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA6P31267 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA6P31267 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA6P31267 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA6P31267 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA6P31267 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA6P31267 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA6P31267 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA6P31267 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA6P31267 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms