Protein–RNA interactions for Protein: P27708

CAD, CAD protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADP27708 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CADP27708 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CADP27708 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms