Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms