Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGCP20142 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGCP20142 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGCP20142 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGCP20142 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGCP20142 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGCP20142 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGCP20142 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGCP20142 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGCP20142 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGCP20142 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PGCP20142 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGCP20142 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGCP20142 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGCP20142 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGCP20142 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PGCP20142 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGCP20142 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGCP20142 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGCP20142 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PGCP20142 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PGCP20142 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PGCP20142 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGCP20142 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGCP20142 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGCP20142 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGCP20142 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGCP20142 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGCP20142 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGCP20142 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGCP20142 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGCP20142 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGCP20142 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGCP20142 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGCP20142 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGCP20142 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGCP20142 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGCP20142 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms